Si la première séance des essais libres du GP du Japon a été dominée par les 3e pilotes, la deuxième séance a vu les pilotes titulaires s'affronter sur une piste allant à s'asséchant, en prévision de la course de dimanche. Cette première passe d'armes a été remportée par le pilote Renault Giancarlo Fisichella qui réalise un chrono en 1'34''337. Le pilote italien devance Felipe Massa et Michael Schumacher. Le Champion du Monde en titre Fernando Alonso s'octroie la 4e place. Les deux 248 F1 chaussées de pneumatiques Bridgestone viennent se glisser dans un peloton de 5 voitures équipées en pneumatiques Michelin. La première partie de cette deuxième séance s'est disputée sur une piste très humide, mais grâce à quelques rayons de soleil, la piste s'est asséché rapidement ce qui a pu permettre aux pilotes de jouer avec les chronos. Seul Adrian Sutil n'a pu participer à cette joute, sa Spyker a rencontré un problème mécanique et le pilote allemand a été contraint de l'abandonner au bord de la piste. A noter que Giancarlo Fisichella, auteur du meilleur chrono s'est fait une petite frayeur à la sortie de Spoon curve.